京舞妓杀人事件告破，但与案件相关联的组织“神和会”仍然是一课调查的对象，并且该组织似乎还和日进化学纤维公司社长——田原雄一郎有着密切的联系。狩矢警部的好友村松博也是一名记者，他在秘密调查着有关田原雄一郎与神和会的情报，他似乎掌握着有关田原雄一郎的秘密，而几天后，村松却惨遭杀害。与此同时，日进化学纤维公司举办的婚纱时装秀拉开序幕，狩矢的女儿和美与美国副总统的女儿凯瑟琳来到了现场。休息室内，婚纱模特水木理沙子被熊熊燃烧的火焰烧死，一课开始对案件进行调查。

正在进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）、小遥（KAORI 配音）和小正（山田ふしぎ 配音），在前往下一个城镇的路上迷失方向。口渴难耐的他们在荒野中偶遇巡回表演的美丽少女洋美（眞鍋かをり 配音）及其所在的玛丽娜剧团，于是随着她们展开愉快的旅行。洋美是水之民的后代，她们此行的目的是将曾被海盗凡顿•绰普（藤岡弘 配音）夺去的苍海王子的蛋送回海之神殿，神殿内则藏着水之民的珍宝海之王冠。邪恶贪婪的凡顿岂能甘心失败，他将与洋美、小精灵护林员杰克（山寺宏一 配音）以及小智一行展开激烈的正邪争夺战……　　本片为神奇宝贝系列第九部电影剧场版。

故事发生在某个晴朗的下午，鲁鲁修与娜娜莉一起度过着安稳的时间。突然，娜娜莉向鲁鲁修请求：“想再听以前在皇宫的庭院哥哥讲的那些充满快乐的故事”。为了满足自己珍爱的妹妹的希望，于是鲁鲁修对《CODE GEASS》系列的登场人物使用GEASS的力量。“鲁鲁修・V・不列颠尼亚命令，《CODE GEASS》的角色们啊，成为我所讲故事的登场人物吧，使我最爱的妹妹娜娜莉高兴！”就这样开始了《CODE GEASS》历史上最大规模的GEASS浪费，新的不思议之国的故事就此上演。